Dalam pertempuran yang sengit, para ninja Sunagakure berusaha menangkis serangan tak terduga dari pasukan prajurit berbaju zirah misterius di Negeri Angin. Tak lama setelah itu, pasukan berbaju zirah yang sama—dipimpin oleh Temujin, seorang ksatria terampil dengan kekuatan luar biasa—menyergap Naruto Uzumaki, Sakura Haruno, dan Shikamaru Nara, yang sedang menjalankan misi untuk menemukan seekor musang yang hilang. Naruto dan Temujin terlibat dalam pertarungan sengit yang berakhir dengan keduanya terjatuh dari tebing.
Terkejut oleh nasib buruk yang menimpa teman mereka secara tiba-tiba, Sakura dan Shikamaru menyaksikan perkembangan mengkhawatirkan lainnya: sebuah struktur raksasa yang bergerak muncul entah dari mana, menghancurkan setiap pohon dan batu di jalurnya. Sementara Sakura berangkat mencari Naruto, Shikamaru menyusup ke benteng yang megah itu dengan harapan mengetahui lebih banyak tentang situasi kritis tersebut.
Terjebak dalam konflik yang tak henti-hentinya, para ninja Konohagakure bergabung dengan rekan-rekan mereka dari Sunagakure untuk mengalahkan musuh bersama. Namun, di tengah kekacauan itu, muncullah pertentangan antara dua visi yang berbeda tentang dunia yang ideal.
