Suatu hari, Kei Kusanagi melihat seorang wanita bercahaya aneh di tepi danau. Dia menemukan bahwa wanita itu sebenarnya adalah seorang perwira alien dari Federasi Galaksi bernama Mizuho Kazami, dan yang lebih mengejutkan lagi, wanita itu juga adalah gurunya! Terlepas dari kemunduran ini, dia dan gurunya secara bertahap saling mengenal dan romansa bersemi di antara mereka. Namun, tak lama kemudian, kepala sekolah mengetahui hubungan mereka. Solusinya? Menikahlah!
Bersama-sama, pasangan pengantin baru ini harus merahasiakan pernikahan mereka, tidak hanya dari teman-teman SMA Kei, tapi juga dari Federasi Galaxy. Onegai☆Teacher adalah kisah cinta yang rapuh namun lucu dari seorang alien dan muridnya.
