Di Kota Fuyuki, Perang Cawan Suci Kelima akan memulai pertempuran darah, kematian, dan kesengsaraan yang panjang. Siswa sekolah menengah Rin Toosaka telah melatih seluruh hidupnya untuk saat ini — untuk menjadi seorang magus yang mampu menjadi Master dalam perang. Memanggil Servantnya yang dikenal sebagai Archer, Rin akhirnya menginjakkan kaki ke pertempuran.
Menemukan bahwa salah satu kenalannya, Shirou Emiya, juga terlibat dalam perang, Rin menawarkan untuk membentuk aliansi untuk saat ini. Dan saat mereka berdua semakin dekat, Rin mulai belajar lebih banyak tentang nasib dan cita-cita Shirou. Namun demikian, tujuannya tetap sama: memenangkan relik mahakuasa yang dapat memenuhi keinginan mereka yang menang setelah perang—Cawan Suci.
